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Le site des « Entre-Côtes du Milieu », à haut intérêt paysager, appartient à l’ensemble forestier de la Haute-Joux et présente des habitats naturels remarquables parmi lesquels on distingue différents types de forêt, une tourbière, des pelouses, des prairies montagnardes et des falaises et éboulis.
Sur la commune de Foncine le Bas, la tourbière du Lac à la Dame marque le nord du Grandvaux.
Ces différentes tourbières renferment des groupements de végétation caractéristiques des hauts-marais acides et des bas-marais.
Sur le bassin supérieur de la Saine, des pelouses sèches submontagnardes thermophiles couvrent les coteaux dominant la partie haute de la vallée au lieu dit le Bayard. Il s’agit d’un type de végétation herbacée installée sur des sols à degré nutritionnel faible et généralement superficiels.
La composition floristique des pelouses du Bayard reste à approfondir. Cependant quelques espèces faunistiques remarquables et d’une grande valeur patrimoniale ont été repèrées. Ainsi cette pelouse abrite de nombreux insectes d'affinité méditerranéenne. Un bel exemple en est fournis par un splendide papillon : l’apollon dont la station reste menacée faute d’une gestion adaptée. La diversité des peuplements de reptiles est élevée (lézard vert par exemple), cette dernière atteignant ici sa limite altitudinale. Enfin, rappelons que les falaises sont de bons sites de nidification pour de nombreuses espèces d'oiseaux protégés (faucon pèlerin, ...).
Les forêts présentent un réel intérêt en raison de la diversité des groupements de versant et de fond de vallée (aulnaie, pessière sur tourbe). Installées sur les pentes fortes, elles offrent une belle opposition de versants ; érablaies sur blocs calcaires, hêtraies xérophiles montagnardes, hêtraies-chênaies à carex mésoxérophiles et hêtraies à dentaire figurent parmi les groupements forestiers les plus intéressants. La hêtraie-sapinière est en position sommitale.
Les éboulis marneux creusés par le ruissellement (sur les Arboux) sont colonisés par des pelouses marneuses à calamagrostis et molinie, groupement rare en Franche-Comté, abritant l'orchis vert et l'orchis odorant . Sur le Bulay, les éboulis calcaires chauds sont colonisés par l'épervière à feuilles de scorzonère.
Une telle variété floristique et la diversité de structure sont extrêmement favorables à une faune typique des milieux montagnards supérieurs. Deux espèces rares sont inféodées à cet environnement : le grand tétras et la gélinotte des bois. Elles sont accompagnées par le pic noir et la chouette de Tengmalm.
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| La partie nord du site Nord du Grandvaux (FR 4301314) est rattachée à ce site. |
| Composition du site : |
| Forêts caducifoliées |
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45 % |
| Forêts mixtes |
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20 % |
| Pelouses sèches, Steppes |
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10 % |
| Prairies semi-naturelles humides, Prairies mésophiles améliorées |
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10 % |
| Marais (vegetation de ceinture), Bas-marais, Tourbières, |
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5 % |
| Rochers intérieurs, Eboulis rocheux, Dunes intérieures, Neige ou glace permanente |
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3 % |
| Landes, Broussailles, Recrus, Maquis et Garrigues, Phrygana |
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3 % |
| Autres terres (incluant les Zones urbanisées et industrielles, Routes, Décharges, Mines) |
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2 % |
| Eaux douces intérieures (Eaux stagnantes, Eaux courantes) |
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2 % |
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10 km 
Appelation :
Région :
